Biyolojik ve tıbbi uygulamalar için, floresan donatılmış mikroskoplar, floroforların yardımıyla canlı hücrelerin ve dokuların belirli kısımlarını gözlemlemek için kullanılır

Numune dokusunun veya hücrelerinin belirli kısımlarına bir veya daha fazla fluofor eklenir. "Uyarma ışığı" olarak adlandırılan ışığa maruz kaldığında, florofor uyarma ışığından gelen enerjiyi emer ve başka bir görünür dalga boyunda ışık yayar. Bu, tümör hücrelerini diğer hücrelerden ayırt etmeyi, antikorların varlığını veya yokluğunu kanıtlamayı veya hücrelerin ve dokuların mikroskobik altı yapılarını gözlemlemeyi vb. mümkün kılar

Euromex floresan mikroskopları, bir olay ışık kaynağı, özel Plan veya Plan Fluarex - isteğe bağlı yarı apokromatik - objektifler, bir dizi uyarma ve emisyon filtresi ve bir dikroik ayna ile yapılır

Dik modellerde modern bir 3 Watt LED iletilen ışık kaynağı ve 100 W cıva buharı aydınlatıcı bulunur. Ters çevrilmiş modellerde 100 W iletilen cıva buharlı aydınlatıcı ve 30 W halojen gelen ışık kaynağı bulunur